在众多血液蛋白质组检测技术中,传统的基于质谱的非靶向方法之外,基于亲和力平台的高通量靶向蛋白质组学技术——PG电子的SomaScan技术和Olink技术备受研究者关注。这两项技术已经为研究者提供了大量数据和有用信息,推动了“蛋白检测双子星”的发展,现已进入了一个全新的竞争阶段。当前,SomaScan已经更新至11K,而Olink则更新至5K。在面对这两种技术时,研究者在选择上可能会面临挑战。为帮助大家更好地理解这两大技术,本文整理了近两年来涉及这两平台的比较研究,涵盖了检测稳定性、精确度、灵敏度及检测蛋白数量等方面的内容,供研究者参考。
第一篇|2023年,该研究分析了48684位UK Biobank参与者的Olink蛋白质组学数据与35892名冰岛国人群的SomaScan蛋白质组学数据,探讨了这些样本中蛋白质水平与基因型和表型之间的关联。研究发现,1514名参与者同时接受了Olink Explore 3072和SomaScan 5K两种检测,并对二者结果进行了详尽比较。结果显示,这两种广泛使用的高通量蛋白质组学平台提供了具价值的信息,并揭示了它们间的差异,这些差异在某些情况下也提供了有用的互补性。原始发表中关于两平台比较的分析存在误差,作者们随后进行了纠正,更新的结果表明,Olink CV值显著高于SomaScan,而SomaScan的精度更高。链接:[点击查看原文](https://wwwnaturecom/articles/s41586-024-07549-z)
第二篇|2025年,该研究比较了两种基于亲和力的蛋白质组学平台(Olink Explore 3072和SomaScan 11K)在4000名中国成年人中对2168种血浆蛋白质的检测性能。主要结论包括:(1)两种平台测量的蛋白水平相关性较低(中位数Spearman相关系数ρ=0.29),其关键因素在于蛋白丰度和数据质量。其中,Olink平台中低于检测下限的样本比例较高,是导致低相关性的主要原因。(2)在1694种唯一匹配的蛋白中,Olink识别出765种有顺式蛋白数量性状位点(cis-pQTLs),而SomaScan识别出513种,其中400种在两个平台上共定位。(3)Olink和SomaScan分别有1096种和1429种蛋白与体质指数(BMI)相关。(4)Olink和SomaScan分别有279种和154种蛋白与缺血性心脏病(IHD)风险相关。(5)将蛋白水平与传统IHD风险因素相结合后,ROC的AUC从0.845提升至0.862和0.863。这些结果展示了这两种平台的实用性,并为未来研究的设计和解释提供了支持。链接:[点击查看原文](https://doiorg/101038/s41467-025-56935-2)
第三篇|2024年,该研究对Atherosclerosis Risk in Communities (ARIC) Study中的102名患者进行SomaScan 11K和Olink Explore HT(5400+蛋白)的同时检测与对比。主要结论:(1)Olink平台上超过50%的蛋白低于一半样本的检测下限,无法检测到,而SomaScan则全部高于检测下限,表明其灵敏度更高。(2)SomaScan的CV中值为68%,显著低于Olink HT的357%。在产品迭代过程中,SomaScan保持了良好的稳定性(66% → 68% → 71%),相比之下,Olink的新蛋白引入导致不稳定性增高。(3)在重复样本的检测中,SomaScan显示出更好的相关性,中位数为0.85,而Olink为0.65。(4)SomaScan的cis-pQTL总数量达到约2800,而Olink则为2100。(5)在双平台共有的超4400种蛋白中,其总体相关性中位值为0.14,其中约三分之一的蛋白呈现良好的跨平台相关性。链接:[点击查看原文](https://doiorg/101101/2024071124310161)
第四篇|2025年,该研究综合使用7种蛋白质组学平台进行78个个体的血浆蛋白质检测与结果比较。主要结论:(1)共鉴定了13007个独特蛋白,其中SomaScan 11K和7K检测到最多的蛋白质,分别为9645个与6401个。(2)SomaScan平台的CV值最低,为最准确和稳定的技术,11K和7K的CV中值分别为53%和58%。而Olink 5K的CV中值是Olink 3K的2倍多。(3)数据完整性方面,SomaScan的完整性最高,11K和7K分别为96.2%和95.8%,而Olink 3K和5K则显著低于此值。(4)在检测蛋白的线性评价中,97%的SomaScan检测蛋白处于线性范围,而Olink 5K仅为42%。(5)SomaScan检测到了最多的FDA批准的人血浆蛋白质生物标志物,分别覆盖了88%和76%。链接:[点击查看原文](https://doiorg/101101/20250214638375)
综上所述,涉及到大样本量的SomaScan与Olink平台检测结果比较显示,整体检测蛋白数量及检测稳定性方面,SomaScan表现更为优越。因此,在进行血液大规模研究时,SomaScan无疑是一个理想选择!
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