生物医疗人士看过来!别再陷入AI焦虑之中!刷满屏的AI攻略只会让人更累!“小白能用Deepseek预测蛋白结构?”“半小时内处理一周的数据?”手残党尝试了三天——错误代码比论文还要多!其实,早该告诉你——PG电子的生物技术服务比野生AI强大10086倍!
不需要学习编程或输入数据,只需放心地交给我们!我们提供五大蛋白表达系统,包括单抗、多抗、纳米抗体定制和多肽合成等服务,实验结果让导师都竖大拇指!面对复杂样本和设计,PG电子凭借多年经验和成熟的系统,迅速交付成果。与其在AI的内卷赛道上慢跑,不如利用成熟的工具实现超车。当然,AI的出现确实是为了给我们提供便利,在实验设计时可以作为参考,毕竟它是强大的信息整合者,能够整理出那些容易被忽视的点。在实验过程中,可以将AI视作一个得力的助手,而非主力军。
今天我们用最近热门的Deepseek来测试一下客户的实际案例,需进行实验设计。首先,我们看看客户的需求:客户通过Co-IP实验确认了A、B两个蛋白有相互作用,想进一步进行体外验证。A蛋白大小为45kDa,亲水性较好,而B蛋白则具有强烈的疏水性且体积较大(275kDa),需要设计一个实验方案,提取A、B蛋白,并验证两者是否互作。
接下来,我们来看看Deepseek的回答。Deepseek首先进行深入思考,展示了每个实验步骤、假设及相关细节。然而,在B蛋白的方案中,出现了一个错误:哺乳动物系统的周期实际上比昆虫系统短,而根据当今成熟的技术,两者的成本也相差不大。随后,Deepseek列出了实际操作方案,首先是A蛋白的表达和纯化。在设计A蛋白表达方案时,没有全面考虑诱导温度和诱导时间,常规操作中,16℃诱导16-20小时也是良好选择。
随后,Deepseek提出了两种B蛋白的表达方式:哺乳动物系统和昆虫系统。选择昆虫系统是明智的,因为考虑到了大蛋白表达的局限性。昆虫-杆状病毒系统的主要优点包括:1) 高效表达外源基因,适合表达大基因和多基因;2) 蛋白质翻译后修饰接近哺乳动物机制;3) 培养体系易于放大,表达水平可达总蛋白的50%;4) 操作简单,杆状病毒基因组易于重组,无需多轮纯化。
考虑到B蛋白的高疏水性(如GPCRs、离子通道),实际操作中,哺乳动物细胞并不能达到理想表达。接下来进行A和B蛋白之间的互作检测,运用常规的GST Pull-down实验。考虑B蛋白的特殊性,还准备了两个替代方案,将A和B共转染到HEK293细胞中,并直接用细胞裂解液进行Pull-down,不得不说,这个思路非常全面。
总的来看,Deepseek的回答分析了所有实验步骤和细节,同时提出了预期结果和可能的失败情况。然而,我们来看PG电子的解决方案:首先分析B蛋白的信号肽、疏水性和跨膜区,实际取得实验结果后选择昆虫杆状病毒表达系统生产B蛋白。
具体步骤包括:1) 合成基因优化的B蛋白,并构建pFast-bac1-B表达质粒;2) 使用蓝白斑筛选获得重组Bacmid,经PCR鉴定阳性后转染sf9细胞,获得P1代病毒粒子,经过P1代表达测试确认目的蛋白表达;3) 生产P2代病毒粒子,进行MOI测试,选择最优条件进行200ml放大与纯化,获得目的蛋白。
随后进行SDS-PAGE考马斯亮蓝染色,成功表达B蛋白,蛋白纯度达到90%,最终进行体外互作实验确认:GST-A蛋白与His-B蛋白确有相互作用,得到可用的实验结果图。通过这个案例的对比,我们发现AI在实验设计中能提供全面的思路,但PG电子凭借专业的生物技术服务将这些设计转化为实际可行的实验操作,并最终获得可靠的实验结果。
在生物科研的道路上,AI和人类的定制服务各有其优势,相辅相成,为科研人员提供更强大的支持和保障。
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